El Colegio Siglo XXI se aproxima en su orientación educativa y estilo de funcionamiento diario a lo que podríamos considerar un régimen d autogestión y relación mutua entre los diversos colectivos que confluyen en un centro de enseñanza: alumnado, profesorado y familias, así como a una concepción general de la escuela que entiende a la misma como uno de los marcos sociales más idóneos para impulsar el desarrollo de los niños y las niñas en todas las facetas de su personalidad. Por último, se acerca una filosofía que considera la educación como uno de los momentos vitales más apropiados para adquirir ideas, principios y actitudes que contribuyan a ir desarrollando una sociedad progresivamente más justa, libre y solidaria.

Ya desde su fundación, efectuada en 1970 para afrontar la grave situación escolar del Barrio de Moratalaz, sus promotores agrupados en régimen de Cooperativa de padres y madres, orientaron sus acciones al logro de dos importantes metas: la renovación pedagógica y la gestión democrática de la escuela. Esta doble reivindicación, necesaria y tanto tiempo reclamada, se constituyó en sistema de referencia, reflejando el espíritu que sigue alentando al colegio actual, ubicado ya desde hace años en otro lugar del barrio y con distinta composición social que la de sus comienzos, pero manteniendo -e incrementando con la aparición de las nuevas leyes de enseñanza- el conjunto de principios educativos que forman la línea pedagógica del centro.